MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-7 DNA

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020824	CCT	2	6	3	8	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020824	TAC	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020824	ATA	2	6	33	38	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020824	TAAAG	2	10	74	83	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020824	CAA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020824	AAG	2	6	172	177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020824	AAT	2	6	204	209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020824	A	7	7	215	221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020824	TAC	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020824	GAT	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020824	TAATT	2	10	478	487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020824	CCT	2	6	926	931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_020824	AGA	2	6	1000	1005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020824	TTG	2	6	1079	1084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020824	ATG	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020824	T	6	6	1139	1144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020824	AGT	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020824	ATT	2	6	1161	1166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020824	CTT	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020824	TGT	2	6	1724	1729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020824	TCATT	2	10	1812	1821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020824	A	6	6	1837	1842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020824	GTT	2	6	1869	1874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020824	T	6	6	1873	1878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020824	AC	3	6	1895	1900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020824	AAC	2	6	1901	1906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020824	A	7	7	1929	1935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020824	CAAA	2	8	1959	1966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020824	TTTC	2	8	1991	1998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020824	TAAC	2	8	2022	2029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020824	TTTAA	2	10	2044	2053	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020824	AAT	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020824	TTTTG	2	10	2314	2323	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020824	CTG	2	6	2353	2358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020824	TTA	2	6	2404	2409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020824	A	6	6	2562	2567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020824	AACG	2	8	2645	2652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020824	GTG	2	6	2749	2754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020824	ACT	2	6	2951	2956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020824	AATT	2	8	2974	2981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020824	AGG	2	6	2992	2997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020824	A	6	6	4459	4464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020824	AGA	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020824	ATT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020824	TGG	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020824	A	6	6	4601	4606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020824	CGAA	2	8	4684	4691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020824	T	6	6	4780	4785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020824	ATT	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020824	TTA	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020824	TTAT	2	8	5341	5348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020824	TAAA	2	8	5408	5415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020824	TTTA	2	8	5429	5436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020824	TAAAT	2	10	5529	5538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020824	A	6	6	5546	5551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020824	AT	3	6	5572	5577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020824	AT	3	6	5687	5692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020824	T	6	6	6331	6336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020824	A	6	6	6347	6352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020824	AT	4	8	6378	6385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020824	TTA	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020824	CCT	2	6	8796	8801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_020824	ATT	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020824	AC	3	6	8827	8832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020824	ATT	2	6	8890	8895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020824	A	6	6	8903	8908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020824	TA	3	6	8942	8947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020824	ATTT	2	8	9040	9047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020824	T	7	7	9045	9051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020824	CCT	2	6	9653	9658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020824	TAC	2	6	9674	9679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020824	ATA	2	6	9683	9688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020824	TAAAG	2	10	9724	9733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020824	CAA	2	6	9750	9755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020824	AAG	2	6	9822	9827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020824	AAT	2	6	9854	9859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020824	A	7	7	9865	9871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020824	TAC	2	6	10042	10047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020824	GAT	2	6	10110	10115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020824	TAATT	2	10	10128	10137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020824	ACC	2	6	10246	10251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020824	ACC	2	6	10264	10269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.